Forskare, postdoc, beräkningsbaserad växtgenomik

Vill du utveckla och utnyttja genomiska metoder på toppnivå? Vi söker en motiverad postdoktoral forskare till det Business Finland-finansierade Q-GEN-projektet, där man undersöker hur kvantberäkning kan tillämpas för att lösa biologiska problem.

Forskaren, postdoc, arbetar inom det Business Finland-finansierade Q-GEN-projektet (Quantum Computing Applications for Future Genomes and Biomaterials).

Den snabba utvecklingen av sekvenseringsmetoder genererar enorma och komplexa omikdata, vars analys utmanar traditionella beräkningsmetoder. Kvantberäkning erbjuder möjligheter att lösa flaskhalsar som är förknippade med analysen av dessa komplexa datamängder, men hittills har kvantdatorer utnyttjats i begränsad utsträckning inom bioinformatiken.

Forskaren blir en del av forskningsgruppen för växtgenetik och genomik vid Naturresursinstitutet (Luke). Till arbetsuppgifterna hör att identifiera bioinformatiska problem där kvantberäkningsmetoder eller hybrida beräkningsmetoder kan tillämpas, utveckla nya algoritmer i samarbete med kvantfysikforskare vid Aalto-universitetet samt tillämpa de utvecklade metoderna i simulerade och verkliga kvantberäkningsmiljöer.

Forskningen fokuserar i första hand på analys av omikdata från växter. Möjliga tillämpningsområden är bland annat estimering av gennätverk och modellering av multiomikdata.

Forskaren handleds av Tuomas Hämälä och Daniel Fischer vid Luke och samarbetar nära med Ilkka Tittonens forskningsgrupp vid Aalto-universitetet. Tjänsten är placerad vid Lukes verksamhetsställe antingen i Jockis eller Helsingfors. I uppgiften ingår möjlighet till forskningsbesök hos internationella samarbetspartner.

en nyligen avlagd doktorsexamen, vanligtvis avlagd för högst fem år sedan, inom ett lämpligt område såsom bioinformatik, genetik, maskininlärning eller datavetenskap

erfarenhet av analys av omfattande omikdata

stark programmeringskompetens, helst i Python

erfarenhet av Unix-baserade miljöer för högpresterande databehandlin