Väitöskirjatutkija / projektitutkija (biologia, puutiaistutkimus)

Turun yliopiston Matemaattis-luonnontieteellisen tiedekunnan Biologian laitoksella on haettavana 2-vuotinen väitöskirjatutkijan/projektitutkijan tehtävä. Työsuhde alkaa 1.9.2026 tai sopimuksen mukaan

Turun yliopiston puutiaistutkimusryhmässä (www.puutiaiset.fi) on tutkittu jo lähes viidentoista vuoden ajan kansanterveydellisesti merkittävien puutiaislajien ja taudinaiheuttajien biologiaa. Osana puutiaistutkimuksia, Turun yliopistolle on perustettu vuonna 2023 Pohjoismaiden ensimmäiset puutiaisten laboratoriopopulaatiot. Palkattava väitöskirjatutkija/projektitutkija tulee osallistumaan Borrelia -bakteerien ja Ixodiphagus hookeri -loispistiäisen loisinnan aiheuttamia muutoksia puutiaisten geenien ilmentymisessä tutkivaan, Suomen Akatemian rahoittamaan projektiin.

Tehtävänkuvaus

Väitöskirjatyö tulee muodostumaan osatutkimuksista, joissa selvitetään, millaisia muutoksia borrelioosia aiheuttavat Borrelia -bakteerit sekä I. hookeri -loispistiäisen loisinta aiheuttavat puutiaisissa ( Ixodes ricinus ) ja taigapunkeissa ( I. persulcatus ). Tehtäviin kuuluvat puutiaisten laboratorioruokinnat, puutiaispopulaatioiden ylläpito, puutiaisten infektoinnit Borrelia -bakteereilla sekä loisituttaminen I. hookeri loispistiäisillä. Ruokintojen ja käsittelyjen jälkeen näytteistä eristetään RNA, minkä jälkeen transkriptomitason muutoksia tutkitaan massasekvensoinnin ja bioinformatiikan keinoin. Työ toteutetaan yhteistyössä monitieteisen Tick-borne Diseases Turku -konsortion (https://sites.utu.fi/tbdturku/) jäsenten kanssa.

Etsimämme henkilö

Haemme tehtävään puutiaisten kanssa työskentelyä pelkäämätöntä ja filosofian tohtorin tutkintoa tavoittelevaa henkilöä, jolta löytyy motivaatiota ja kiinnostusta oppia ja/tai syventää osaamistaan RNA-työskentelyyn ja transkriptomiikassa vaadittavaan bioinformatiikkaan liittyen. Aikaisempi kokemus bioinformatiikasta ja molekyyligenetiikan laboratoriotyöskentelystä katsotaan eduksi, etenkin suora kokemus geeniekspressiotutkimuksesta tai transkriptom